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基于人工智能的新冠病毒虚拟变异评估和预警系统问世

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近日,国家微生物科学数据中心联合国内有关单位发布了“新型冠状病毒变异评估和预警系统”(SARS-CoV-2 Variations Evaluation and Prewaning System,简称VarEPS),成为全球首个对SARS-CoV-2基因组已知变异及虚拟变异进行多维度风险评估和预警的系统。相关研究成果已于20211011日发表在国际学术期刊《核酸研究》上。

VarEPS系统从基因组学和结构生物学角度入手,在基于变异位点频率评估的基础上,从核苷酸变异发生难易程度、氨基酸替换难度、变异对蛋白质二级结构的影响、单个氨基酸突变引起的ACE2及中和抗体结合自由能变化等参数对变异进行多维度的评估,全面对已知变异和潜在的虚拟变异对病毒的功能造成的影响进行综合分析。在此基础上,该系统采用人工智能分类器算法,将变异株从传播性和对中和抗体亲和力两方面进行有效分组,实现了基于病毒序列的风险评估和预警。

信息来源:

http://www.ncsti.gov.cn/kjdt/kjrd/202110/t20211015_49362.html

https://academic.oup.com/nar/advance-article-abstract/doi/10.1093/nar/gkab921/6389500

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