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中美研究团队建成迄今最大的小鼠全脑神经元数据集

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东南大学联合美国艾伦脑科学研究所、华中科技大学、温州医科大学、腾讯公司等机构,生成了目前世界上数目最大的关于小鼠的1741个单细胞神经元的数据集,并鉴定了来自皮层、屏状核、丘脑和纹状体等脑区的11种主要神经元投射类型。相关研究成果于2021106日发表于《自然》杂志上。

此次研究中,研究团队构建了选择性标记的小鼠品系样本,并完成了基于荧光显微光学切片断层成像系统的高分辨率小鼠全脑图像采集。但高达1520TB的数据量对图像平台的算法和数据处理能力形成很大挑战。为此,研究团队开发了三维可视化Vaa3D-TeraVR平台,研究人员可头戴VR设备,“沉浸式观察”神经元结构,大大降低了重建繁杂难辨的神经元的难度。同时,研究团队建立了自动化与手动结合的神经元重建流程并研发出图像配准算法mBrainAligner,使神经元的形态“捕捉”变得更加高效、精准。基于上述平台和算法,研究团队建立起完整的大数据管理和计算分析平台。

信息来源:

https://www.nature.com/articles/s41586-021-03941-1#citeas

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